一份来自一位48岁患者的淋巴结活检标本揭示了致死性病毒的历史。---Heidi Ledford
研究者发现,一份来自一位近50岁的非州妇女活检标本中存在微量的HIV基因组。通过对新发现的标本进行序列分析表明,人类感染该病毒已近百年。
虽然直到20世纪80年代,人们才认识到艾滋病(AIDS)。但早在那之前,人类就已被HIV病毒感染了。研究者希望通过研究HIV的起源和衍化,可以了解更多关于这种病毒是如何从黑猩猩传到人类并且设计如何制备出最好的抗该病毒疫苗。
在1998年,研究者报道,一份于1959年取自一位住在Leopoldville班图男性的血液标本中,分离出HIV-1的序列。Leopoldville现在是刚果共和国的首都Kinshasa。 通过对这份标本以及其他样本的分析表明,HIV-1最早出现于1915年到1941。
现在,研究者发表于《自然》杂志的报道称他们发现了另一份组织标本,该标本于1960年取自一位也住在Leopoldville的女性。
在开始追踪这份来自Kinshasa大学1960年的淋巴结活检前,亚利桑那大学的进化生物学家Michael和他的同事花了8年时间寻找来源于非洲的合适组织标本。
浸在胶中
该标本被强化学剂处理过,并且包埋于固体石蜡中并在室温下保存了数十年。这些酸性化学物质将基因组打碎成许多小片段。福尔马林,一种用于镜检前的化学试剂,它可以使核酸和蛋白交联。“这就像你有一串由DNA、RNA和蛋白质穿成的珍珠项链。并且,你把它们拧成一团,泡在胶中,然后晾干。”
该小组设计出一种可以让在标本中测定DNA和RNA序列的联合方法。另一个在伊利诺斯,芝加哥西北大学的研究小组证实了结果,他们也在淋巴结活检组织中发现痕量的HIV-1基因组
利用HIV-1序列数据库以及对这些序列随时间推移而出现改变速度的估算,研究者建立了HIV第一次出现的时间。他们的研究结果表明,HIV出现最可能的时间是1908年,那时Leopoldville是贸易中心。
虽然多数HIV研究者对这个数据并不感到惊奇,但是新的数据可以帮助説服那些不相信1959年取样标本结果的人。
通过对发现HIV最早的时间1959年到1960年取样的标本进行测序,结果表明差异约为12%。巴黎巴斯德研究所的一位病毒学家Simon Wain-Hobson说,“这表明,即使在那时,也存在明显的变异性。”
一株准备密切关注的病毒
Hahn提醒到,也许永远不可能明确阐述HIV是怎样从黑猩猩传播到人类的。她和她的同伴早前追踪居住在喀麦隆东南部黑猩猩的HIV感染源,这个地方离Kinshas仅有数百公里。并且,他们试图假设部落常规活动使病毒侵入城市。但是,即使到1960年,HIV仅感染少数非洲人。不太可能追踪到最早受害者的标本
同时,Worobey计划继续他的研究,通过收集陈旧组织以期发现其他标本。他说,这可能为进一步研究重建HIV的历史。
收集HIV古老菌株的信息。虽然随着时间的流失,这些信息会消失,但是这可以帮助研究者了解菌株是如何成功突破的。“对于每一位好莱坞的影星而言,都有15颗小星星(PS:都需要经过磨练)”“我们也很愿意了解这个菌株如何从一颗小星星变成大明星的。”